Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms