Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Taf6Q62311 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Taf6Q62311 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Taf6Q62311 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Taf6Q62311 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Taf6Q62311 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Taf6Q62311 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Taf6Q62311 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Taf6Q62311 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms