Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SnrpcQ62241 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
SnrpcQ62241 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SnrpcQ62241 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SnrpcQ62241 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SnrpcQ62241 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SnrpcQ62241 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SnrpcQ62241 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SnrpcQ62241 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SnrpcQ62241 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SnrpcQ62241 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SnrpcQ62241 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SnrpcQ62241 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SnrpcQ62241 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SnrpcQ62241 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SnrpcQ62241 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SnrpcQ62241 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SnrpcQ62241 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SnrpcQ62241 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SnrpcQ62241 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SnrpcQ62241 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SnrpcQ62241 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SnrpcQ62241 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms