Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AtrxQ61687 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
AtrxQ61687 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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AtrxQ61687 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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AtrxQ61687 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
AtrxQ61687 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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AtrxQ61687 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
AtrxQ61687 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
AtrxQ61687 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
AtrxQ61687 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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AtrxQ61687 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
AtrxQ61687 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
AtrxQ61687 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
AtrxQ61687 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
AtrxQ61687 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
AtrxQ61687 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
AtrxQ61687 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
AtrxQ61687 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
AtrxQ61687 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
AtrxQ61687 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
AtrxQ61687 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
AtrxQ61687 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
AtrxQ61687 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms