Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ecm1Q61508 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ecm1Q61508 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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