Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms