Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atf3Q60765 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms