Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf123Q5XPI3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf123Q5XPI3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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