Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.3 ms