Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fam208bQ5DTT3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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