Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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Znf608Q56A10 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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Znf608Q56A10 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms