Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc110Q3V125 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc110Q3V125 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc110Q3V125 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc110Q3V125 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc110Q3V125 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc110Q3V125 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc110Q3V125 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc110Q3V125 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc110Q3V125 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc110Q3V125 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc110Q3V125 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc110Q3V125 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms