Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp48Q3V0C5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp48Q3V0C5 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Usp48Q3V0C5 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Usp48Q3V0C5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Usp48Q3V0C5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
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