Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc27Q3V036 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms