Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Chpf2Q3UU43 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Chpf2Q3UU43 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Chpf2Q3UU43 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Chpf2Q3UU43 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Chpf2Q3UU43 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Chpf2Q3UU43 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Chpf2Q3UU43 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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