Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Shisa3Q3UPR0 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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