Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms