Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Edc4Q3UJB9 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms