Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdhd2Q3UGR5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdhd2Q3UGR5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdhd2Q3UGR5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdhd2Q3UGR5 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdhd2Q3UGR5 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdhd2Q3UGR5 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdhd2Q3UGR5 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdhd2Q3UGR5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdhd2Q3UGR5 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdhd2Q3UGR5 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdhd2Q3UGR5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdhd2Q3UGR5 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdhd2Q3UGR5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdhd2Q3UGR5 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hdhd2Q3UGR5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms