Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms