Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pid1Q3UBG2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms