Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Cops9Q3U898 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Cops9Q3U898 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Cops9Q3U898 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Cops9Q3U898 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Cops9Q3U898 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Cops9Q3U898 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Cops9Q3U898 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Cops9Q3U898 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Cops9Q3U898 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Cops9Q3U898 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Cops9Q3U898 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Cops9Q3U898 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Cops9Q3U898 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Cops9Q3U898 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Cops9Q3U898 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Cops9Q3U898 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Cops9Q3U898 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Cops9Q3U898 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Cops9Q3U898 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms