Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf40Q3U319 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Rnf40Q3U319 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnf40Q3U319 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf40Q3U319 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf40Q3U319 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnf40Q3U319 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf40Q3U319 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf40Q3U319 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnf40Q3U319 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf40Q3U319 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnf40Q3U319 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf40Q3U319 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnf40Q3U319 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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