Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf149Q3U2C5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms