Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms