Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Prr27Q3SYJ2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Prr27Q3SYJ2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Prr27Q3SYJ2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Prr27Q3SYJ2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Prr27Q3SYJ2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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Prr27Q3SYJ2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Prr27Q3SYJ2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Prr27Q3SYJ2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Prr27Q3SYJ2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Prr27Q3SYJ2 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prr27Q3SYJ2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms