Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl9Q32KG4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms