Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Col24a1Q30D77 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Col24a1Q30D77 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Col24a1Q30D77 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Col24a1Q30D77 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Col24a1Q30D77 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col24a1Q30D77 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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