Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim71Q1PSW8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms