Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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VgfQ0VGU4 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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VgfQ0VGU4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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VgfQ0VGU4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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VgfQ0VGU4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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VgfQ0VGU4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VgfQ0VGU4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms