Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp2b3Q0VF55 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms