Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Chd8Q09XV5 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Chd8Q09XV5 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Chd8Q09XV5 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Chd8Q09XV5 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd8Q09XV5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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