Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cnn2Q08093 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cnn2Q08093 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cnn2Q08093 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cnn2Q08093 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Cnn2Q08093 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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