Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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Gdf3Q07104 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms