Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Sh3bp2Q06649 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Sh3bp2Q06649 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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