Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1sQ02789 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms