Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms