Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ascl1Q02067 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms