Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms