Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rbp4Q00724 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms