Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms