Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms