Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Irx1P81068 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Irx1P81068 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Irx1P81068 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Irx1P81068 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx1P81068 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Irx1P81068 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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Irx1P81068 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Irx1P81068 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Irx1P81068 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Irx1P81068 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Irx1P81068 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Irx1P81068 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Irx1P81068 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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