Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ptprn2P80560 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptprn2P80560 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms