Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chl1P70232 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms