Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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