Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SbdsP70122 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms