Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UbdP63072 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms