Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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