Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P58686 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P58686 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms